RStan 2.0.0 は OS X Mavericks にインストール不可（追記あり）：Taglibro de H：SSブログ

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RStan 2.0.0 は OS X Mavericks にインストール不可（追記あり）　[Mac] [編集]

OS X Mavericksは無償アップグレード可能ということで、まず1台でテスト。

順調にアップグレードできたが、RStan 2.0.0はインストール不可能だった。

/usr/bin/gnutarが見つからないのには、Sys.setenv(TAR = "/usr/bin/tar")で対処。llvm-g++-4.2が見つからないというエラーにはRstan with Xcode 5 in OSX (1 Oct): F. E. R.を参考に対処。しかしインストール最後で次のエラーがでる。

** testing if installed package can be loaded
Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) :
  unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.0/Resources/library/rstan/libs/rstan.so':
  dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.0/Resources/library/rstan/libs/rstan.so, 6): Symbol not found: __ZNK4Rcpp7RObject4attrERKNSt3__112basic_stringIcNS1_11char_traitsIcEENS1_9allocatorIcEEEE
  Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.0/Resources/library/rstan/libs/rstan.so
  Expected in: flat namespace
 in /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.0/Resources/library/rstan/libs/rstan.so
Error: loading failed
Execution halted

Stanのメーリングリストをみると、まだ解決されていない模様。

※ 追記

"-stdlib=libstdc++"というオプションをつけるとインストールに成功したとのこと。

タグ：RStan