QGIS: manageRのエラー

QGISのmanageRを起動しようとすると下のようなエラーが発生することがある。ただ、必ずエラーになるのではなく、なんどか繰り返していると起動に成功する。

  File "/Library/Python/2.6/site-packages/rpy2/rinterface/__init__.py", line 6, in
 
    R_HOME = os.popen("R RHOME").readlines()

IOError: [Errno 4] Interrupted system call

Pythonのsignal handlerまわりの問題らしい。

で、rpy2/rinterface/__init__.pyの6行目あたりを見ると、

try:
    R_HOME = (os.environ["R_HOME"], )
except KeyError:
    R_HOME = os.popen("R RHOME").readlines()

ということは、あらかじめ

export R_HOME=/Library/Frameworks/R.framework/Resources

などとして環境変数を設定しておけばよい。これで確実にmanageRが起動するようになった。

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