SSブログ

64bit JAGS [統計]

64bitなJAGSをビルドしてみた。
F77=/opt/bin64/ifort CXXFLAGS="-O3 -arch x86_64" ./configure --with-blas="-lmkl_intel_lp64 -lmkl_intel_thread -lmkl_core -lguide -lpthread" --prefix=/usr/local/jags64
make
sudo make install


でも、JAGS公式サイトで配布しているJAGS 1.0.3 Mac用バイナリも64bitバイナリを含むユニバーサルバイナリになっている。速度を比べてもほとんど同じ。

ただし、JAGS 1.0.3 Mac用バイナリをSnow Leopardにインストールしようとするとバージョンチェックではねられる。しかし、JAGS 1.0.3u.mpkgのパッケージの中を開いて、jagsu10.pkgからインストールすると大丈夫。

[追記]
上の./configureには、"-framework Intel_MKL"を入れておかないといけないのかも。
F77=/opt/bin64/ifort CXXFLAGS="-O3 -arch x86_64 -framework Intel_MKL" ./configure --with-blas="-lmkl_intel_lp64 -lmkl_intel_thread -lmkl_core -lguide -lpthread" --prefix=/usr/local/jags64

ちょっと速くなった感じ。なお、CCはgcc-4.2.1。
タグ:jags
nice!(0)  コメント(0)  トラックバック(0) 
共通テーマ:パソコン・インターネット

nice! 0

コメント 0

コメントを書く

お名前:
URL:
コメント:
画像認証:
下の画像に表示されている文字を入力してください。

Facebook コメント

トラックバック 0