64bit JAGS [統計]
64bitなJAGSをビルドしてみた。
でも、JAGS公式サイトで配布しているJAGS 1.0.3 Mac用バイナリも64bitバイナリを含むユニバーサルバイナリになっている。速度を比べてもほとんど同じ。
ただし、JAGS 1.0.3 Mac用バイナリをSnow Leopardにインストールしようとするとバージョンチェックではねられる。しかし、JAGS 1.0.3u.mpkgのパッケージの中を開いて、jagsu10.pkgからインストールすると大丈夫。
[追記]
上の./configureには、"-framework Intel_MKL"を入れておかないといけないのかも。
ちょっと速くなった感じ。なお、CCはgcc-4.2.1。
F77=/opt/bin64/ifort CXXFLAGS="-O3 -arch x86_64" ./configure --with-blas="-lmkl_intel_lp64 -lmkl_intel_thread -lmkl_core -lguide -lpthread" --prefix=/usr/local/jags64 make sudo make install
でも、JAGS公式サイトで配布しているJAGS 1.0.3 Mac用バイナリも64bitバイナリを含むユニバーサルバイナリになっている。速度を比べてもほとんど同じ。
ただし、JAGS 1.0.3 Mac用バイナリをSnow Leopardにインストールしようとするとバージョンチェックではねられる。しかし、JAGS 1.0.3u.mpkgのパッケージの中を開いて、jagsu10.pkgからインストールすると大丈夫。
[追記]
上の./configureには、"-framework Intel_MKL"を入れておかないといけないのかも。
F77=/opt/bin64/ifort CXXFLAGS="-O3 -arch x86_64 -framework Intel_MKL" ./configure --with-blas="-lmkl_intel_lp64 -lmkl_intel_thread -lmkl_core -lguide -lpthread" --prefix=/usr/local/jags64
ちょっと速くなった感じ。なお、CCはgcc-4.2.1。
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