キビタキ

キビタキ今季初認。平岸霊園にて。

タグ：鳥

フクジュソウにハナアブ

フクジュソウにハナアブ

タグ：花

『ハエトリグモハンドブック増補改訂版』『となりのハト』『Rではじめる地理空間データの統計解析入門 』ほか

MARUZEN&ジュンク堂札幌店にて購入。


ハエトリグモハンドブック 増補改訂版
須黒達巳
文一総合出版

となりのハト 身近な生きものの知られざる世界
柴田佳秀
山と溪谷社


Rではじめる地理空間データの統計解析入門
村上大輔
講談社

新・鉄道廃線跡を歩く1 (北海道・北東北編)
今尾恵介
JTBパブリッシング

新・鉄道廃線跡を歩く3 (北陸・信州・東海編)
今尾恵介
JTBパブリッシング

タグ：本

フクジュソウ

フクジュソウ

タグ：花

モデル選択後の係数分布(2)

選択されたモデルという条件付きでは、係数の推定値に偏りが生じるという例です。

なお、AICは正しいモデルを選ぶためのものではないです（念のため）。

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タグ：AIC モデル選択

モデル選択後の係数分布

Kuchibhotla et al. (2022)を参考に、モデル選択後の係数の分布を求める例をやってみました。

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タグ：AIC モデル選択

パス解析とAIC比較

昨日の生態学会の自由集会「フィールドワークと統計モデリング：「現場の勘」の活かしどころ」での大久保先生の講演の予備資料"生態学と因果推論1"では、AICによるモデル選択がバイアスを伴うモデルを選択する例がしめされています。

ここではさらにパス解析でどうなるかを試してみました。そもそもパラメータが増えるので、AICはさらに大きくなりそうですが。

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タグ：パス解析 AIC

NIMBLEによるCARモデル

NIMBLEで、Intrinsic CAR (Conditional AutoRegressive) モデルのあてはめをやってみました。

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タグ：Nimble

NIMBLEによるCJSモデル

nimbleEcologyつかわずに、NIMBLEでCJSモデルのあてはめをやってみました。

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タグ：Nimble

NIMBLE並列実行

parallelパッケージをつかって、NIMBLEのMCMC計算を並列化してみました。mclapply関数を使用しているのでWindowsでは動作しません（parLapplyをつかってください）。

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タグ：Nimble