[Stan] multinomialをつかった回帰 [統計]
3種の生物が生息している地域のN地点でそれぞれM個体を採取する。採取した3種の個体数(の割合)と共変量Xとの関係を分析する。という設定をかんがえてみたテストです。
コードです。
データです。
結果です。
mean se_mean sd 2.5% 25% 50% 75% 97.5% n_eff Rhat alpha[1] 3.35 0.04 1.15 1.17 2.64 3.32 4.09 5.62 881 1.00 alpha[2] -0.08 0.02 0.48 -0.98 -0.34 -0.07 0.20 0.77 905 1.00 alpha[3] -3.36 0.01 0.48 -4.27 -3.65 -3.35 -3.07 -2.47 1233 1.00 beta[1] -6.55 0.04 1.34 -9.27 -7.42 -6.48 -5.68 -4.13 1162 1.00 beta[2] -0.05 0.03 0.72 -1.42 -0.40 -0.02 0.38 1.12 621 1.00 beta[3] 6.14 0.06 1.59 2.88 5.27 6.21 7.09 9.00 697 1.00 lp__ -934.31 0.06 1.92 -938.95 -935.31 -933.93 -932.92 -931.71 900 1.01
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