データを公開せよ [科学]
Whitlock, Michael C. (2011) Data archiving in ecology and evolution: best practices. Trends in Ecology & Evolution 26(2): 61–65.
研究に使用したデータの公開が求められてるようになってきている。昨年参加した「データ解析環境Rの整備と利用」でも"Reproducible Research"という話題があった。
リポジトリとしては以下のようなところが紹介されている。
あと、いくつかメモなど。
研究に使用したデータの公開が求められてるようになってきている。昨年参加した「データ解析環境Rの整備と利用」でも"Reproducible Research"という話題があった。
リポジトリとしては以下のようなところが紹介されている。
- Dryad
- KNB
- GenBank (DNA sequences)
- TreeBASE (phylogenetic trees)
- GEO (microarrays)
- VegBank (vegetation plots)
- CUAHSI-HIS (hydrology data)
あと、いくつかメモなど。
- メタデータをつける。EML形式など。
- 希少種の生息地の情報や、人権には配慮すべし。
- プロプライエタリなフォーマット(WordとかExcel)ではなく、テキストファイルやCSVファイルをつかうべし。
- データを再利用するときは、もとの仕事に敬意をはらうこと。直接作者に連絡をとるのがよい。
- 雑誌は、データの引用を促進すべし。
リポジトリとか、ソフトのアラーム等でで突然出てきて、何だかわからないし、
プロプライエタリとか聞いたような気がしながらも、わからない単語。
ソフトのヘルプを見ても当たり前なのか、わからないし。
面倒な世の中だなーと思っています。
by 春分 (2011-01-29 19:24)
repository/ripάzətɔ̀ːri | -pɔ́zitəri/
名 詞
1 容器;集積所, 置き場, 貯蔵室, 収納庫;⦅主に英⦆倉庫
(プログレッシブ英和・和英中辞典)
ということなのですが、たしかに普通の日本語ではありませんね。
ちなみに、
proprietary/prəpráiətèri | -təri/
形容詞⦅形式的⦆
1 製造販売の独占権を持つ, 専売特許の
(プログレッシブ英和・和英中辞典)
で、ソフトウェア業界界隈ではオープンとかフリー(自由の意味で)の対語です。
by hiroki (2011-01-30 06:05)
解説ありがとうございます。
でも、やっぱり面倒な世の中という気がします。
by 春分 (2011-02-05 18:11)
コンピュータとかネットの業界はこういうのが多いですね。
by hiroki (2011-02-05 20:36)